一、修剪花枝
百合花开败后，需要及时将残花剪除，同时还要将花枝剪掉一部分，保留20-30厘米长就可以了。这样可以减少养分的消耗，对于种球的发育很有帮助。如果不进行修剪，种球第二年复花的效果就会减弱，甚至完全不开花。
二、补充水肥
百合花在花后会逐渐枯萎，但这并不意味着就要停止浇水施肥了，因为此时是养球阶段，水肥是否充足决定了第二年开花的情况。通常浇水要等到土壤干燥后进行，因为此时水分不容易散发，所以浇水太多也不行，一旦有积水要立刻排出，不然会导致种球腐烂。而施肥可以和生长期一样，但可以减少频率，同时注意肥料的浓度，以免烧伤根系。
三、保存种球
等到百合花地上部分完全枯萎后，就要注意保存种球了。种球可以取出，埋到湿沙中，这样可以保温保湿，同时也不会让它提前生长。如果不取出的话，也可以带着花盆一起放到通风阴凉的地方，如果盆土干透了，就适当喷水，等到入春气温上升之后，就可以重新取出养护了。